Церковь и монастырь Сан-Дамиано находятся недалеко от центра Ассизи. Первоначально комплекс был бенедиктинским монастырем, записи о котором датируются 1030 годом. Вы попадаете в церковь через часовню: справа вы найдете Мадонну с Младенцем и святыми Франциском, Кларой, Бернардино и Джеромом, фреску местного художника середины четырнадцатого века. Церковь имеет один неф с оживленными бочкообразными сводами и глубоким хором. Сразу справа от входа находится окно, из которого святой Франциск выбросил деньги, от которых отказался священник Сан-Дамиано на восстановление церкви. Вдоль стен можно увидеть остатки штукатурки, окаймленные полихромными рамами, подготовленными для фресок, которые так и не были сделаны. В часовне, которая была пристроена в 1535 году, находится деревянное Распятие (выражение лица Христа меняется в зависимости от точки обзора), вырезанное фра Инноченцо да Палермо в 1637 году. У главного алтаря находится копия Распятия, которое говорило со святым Франциском (оригинал хранится в базилике Санта-Кьяра). Деревянные хоры 1504 года частично закрывают небольшое окно, через которое общались Бедные Клары и перед которым тело святого Франциска было перенесено из Порциунколы в Ассизи. Войдя в вестибюль справа, под которым были похоронены четверо спутников Святой Клары, вы попадаете в ризницу. Слева находится простой хор, где вы также найдете кафедру Святой Клары. На алтаре находится Распятие, фреска Пьера Антонио Меццастриса 1482 года. Слева вы можете увидеть небольшую комнату, где, согласно преданию, Франциск укрылся от своего отца. Возвращаясь в вестибюль, вы поднимаетесь по нескольким ступенькам, выходя направо через Джардинетто ди Санта-Кьяра (сад Святой Клары), небольшую террасу с видом на равнину внизу. Вместо этого, спустившись в монастырь, вы можете полюбоваться на двух угловых стенах фресками Эусебио да Сан-Джорджо (1507), изображающими Святого Франциска, получающего стигматы, и Благовещение. Затем вы попадаете в прямоугольную трапезную с низкими потолками, похожую на склеп, с ее оригинальными скамьями и столами: крест и ваза с цветами отмечают место, которое когда-то занимала Святая Клара.