Настоящий ранний центр францисканства, Порциункола, стал одним из самых важных мест паломничества, настолько, что папа Благочестивый V в конце Трентонского собора решил построить эту грандиозную базилику с целью дать новую жизнь Ордену Малых братьев и достойный прием для многих верующих, которые уже посещали Порциунколу. Церковь имеет три нефа, с не выступающим трансептом, перекрестно-купольным планом и полукруглой апсидой, спроектированной Галеаццо Алесси; она была завершена в 1679 году строительством колокольни справа, которая должна была соответствовать колокольне слева, которая заканчивается чуть выше крыша церкви . Землетрясения 1832 года привели к обрушению центрального нефа до поперечного свода, секций боковых и верхней части фасада, в то время как купол и апсида были сохранены. Центр базилики, то есть часовня Порциункола, выглядит как небольшая церковь, расположенная прямо под куполом. В начале 13 века церковь была заброшена среди дубов, принадлежавших бенедиктинским монахам Субазио. Примерно в 1205 году Франциск основал там свой дом, восстановил церковь и основал орден францисканцев. Первые хижины для монахов, сделанные из глины и тростника, были построены вокруг Порциунколы. Это было место, где святой Франциск жил чаще всего, где он дал святой Кларе ее религиозное одеяние (1212) и где он провел Капитул Матса (1221), в котором приняли участие более 5000 монахов. Традиция гласит, что здесь святой Франциск получил полную индульгенцию от Девы Марии. Порциункола - это очень простая прямоугольная конструкция, выполненная из полихромного камня из Субазио. Верхняя часть фасада покрыта фреской ("Прощение Ассизи") Фридриха Овербека из Любека (1829). С правой стороны находятся остатки двух фресок пятнадцатого века с сиенским влиянием: Мадонна с Младенцем между Святым Франциском и Святым Бернардином. В задней части находится фреска Перуджино "Голгофа" (верхняя часть которой утеряна). Интерьер (дверные молотки относятся к пятнадцатому веку) имеет поперечный ребристый свод, немного почерневший от дыма от ламп; у алтаря - Благовещение и истории прощения, большое панно Иларио да Витербо (1393), который также сделал фреску на стене. склеп с евангелистами; на левой стене - фреска с изображением Имаго Пьетатиса.